Em nature agent, você está usando a palavra nature como adjetivo. A ênfase recai sobre sobre o substantivo agent. Seria um 'agente tipo natureza'.

Em nature's agent ou agent of nature, a palavra nature permanece substantiva e a ênfase fica igualmente distribuída entre os dois substantivos. Seria um 'agente a serviço da natureza'; provavelmente o sentido que você procura.

Ricardo - EMB